La serie muestra las aventuras de un misterioso extraterrestre y viajero en el tiempo conocido como El Doctor que explora el tiempo y el espacio en su nave TARDIS con sus compañeros, arreglando problemas y corrigiendo errores.
El protagonista va viajando en el tiempo solucionando problemas y paradojas que van ocurriendo alrededor suya y de sus amigos, una chica joven e inteligente y un colega de aventuras algo tontorrón pero siempre preparado, aunque siempre irá conociendo a muchos más amigos continuamente. De igual forma, sus enemigos irán abriéndose paso para entorpecerle, intentando que no logre desbaratar sus planes maléficos o solucionar el problema ante el que se enfrenta.
Esta serie, que ha ido escalando a lo largo de muchísimo tiempo (desde el 1963 hasta la actualidad, en el 2012) a cambiado varias veces de actor y situación, pero mantiene siempre fresco su tono de ciencia ficción extravagante con tintes irónicos en sus capítulos.