La historia transcurre en el siglo XXII, cien años antes de las aventuras del capitán Kirk y su tripulación en 'Star Trek: La serie original'. El capitán Jonathan Archer inicia la exploración del espacio en nombre de la humanidad, con la intención de establecer relaciones pacíficas con nuevas civilizaciones, a bordo de la nave experimental Enterprise NX-01. A lo largo de sus viajes descubrirán nuvas razas, formas de vida y culturas que se mostrarán cautas y poco abiertas a ser visitadas, poniéndolos en serios aprietos.

Toda la tripulación siempre actuará de forma pacífica, aunque no dudará en mostrar sus armas más avanzadas para plantar ataque a quien fuera pertinente. La camadería entre todos es una constante que se mantiene siempre altiva.

Al final de todos los capítulos el viaje continuará en pos de seguir abriendo nuevas rutas en el espacio infinito.