Twin Peaks cuenta la historia del Agente Especial del FBI Dale Cooper y su investigación del asesinato de una chica local muy popular, Laura Palmer. También muestra la vida social en un pueblo de los Estados Unidos.

Los eventos narrados se cuentan a razón de un día por episodio (salvo excepciones). A medida que pasan los días -y los capítulos- en agente va descubriendo que cada habitante tiene extraños secretos y extravagantes pruebas relacionadas con el caso. La apariencia normal de la pequeña ciudad de Twin Peaks comienza a esfumarse, revelando varios secretos que muestran los aspectos más perturbados de la ciudad.